Download Angewandte Bioinformatik: Eine Einfuhrung by Priv.-Doz. Dr. Paul M. Selzer, Dipl.-Ing. Richard J. PDF

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By Priv.-Doz. Dr. Paul M. Selzer, Dipl.-Ing. Richard J. Marhöfer, Dr. Andreas Rohwer (auth.)

Durchblick durch die Informationsflut einer aufstrebenden Wissenschaft

Als die Bioinformatik noch in den Kinderschuhen steckte, waren Programmierkenntnisse nötig, um mit den kryptischen Programmen zu arbeiten. Ihren increase verdankt sie dem rasanten Wachstum im Bereich Informatik und den damit einher gehenden demanding- und Software-Entwicklungen sowie dem Siegeszug des WWW.

Heute gehören Techniken wie Sequenzsuchen mit dem BLAST-Algorithmus, paarweise und a number of Sequenzvergleiche, Abfragen biologischer Datenbanken, die Erstellung phylogenetischer Untersuchungen und vieles mehr zum täglichen Handwerkszeug eines Naturwissenschaftlers.

Der Leser lernt die biologischen Grundlagen, die Werkzeuge der Bioinformatik, ihre Verfügbarkeit, den Ort ihrer Verfügbarkeit und ihr sicheres Handhaben kennen.

Übungen, die an jedem laptop mit Internetzugang durchgeführt werden können, helfen, das Gelernte zu vertiefen.

Diese Einführung in die "angewandte Bioinformatik" strukturiert eine komplexe wissenschaftliche Thematik.

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Gz). gz) im Dateinamen ausgelassen, werden die Dateien vor dem eigentlichen Download automatisch dekomprimiert. Vergewissern Sie sich, bevor sie mit dem Download beginnen, ob dies auf dem von Ihnen benutzen Computer gestattet ist. Zeigen Sie die ersten 35 Zeilen einer der drei Dateien auf dem Bildschirm an. Literatur 16. Zeigen Sie die Zeilen der drei Dateien an, die den Begriff contig enthalten. 17. Wie viele Zeilen besitzen die drei Dateien und wie viele Zeilen enthalten den Begriff Sequence?

E> Sucht nach einem oder mehreren Stichworten in den Manual-Seiten. Identisch mit dem Kommando man -k. eien> Gibt den Inhalt der angegebenen Dateien auf dem Bildschirm aus. fas auf dem Bildschirm an. cat. sequence. fas, cd cat. seql. fas seq2. fas cd seq3. fas > Andern des aktuellen Verzeichnisses. Beispiel: Wechsle in das Verzeichnis /usr/people/jdoe. eien> Kopiert Dateil nach Datei2 oder kopiert mehrere Dateien in ein Verzeichnis. fas im Verzeichnis /scratch. fik cp seq.

Cloning and sequence of REV7 , a gene whos e function is required for DNA damage -induced mutagenes is in Saccharomyces cerevisiae Location/Qualifiers 1. 5028 /organism= "Saccharomyces cerevisiae " /db_xref= "ta xon: 4932 " /chromosome= I1IX " /map~ "9 " CDS <1. 2 0 6 /codon_start~3 Iproduct="TCPl-beta ll /protein_ id~ "AAA98665. l" /db_ xref~ "GI:1293614 " /translation~ "SS I YNGISTSGL DLN NG T[ g ene 687 . 3158 CDS 687 . 3158 Igene=IIAXL2 .. ]RQHM" 11 /gene~"AXL2 " /note="plasma membrane glycoprotein " /codon_sta rt~l Ifunction= t1 re quired for a xial budding patte rn of S.

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